Protein–RNA interactions for Protein: P61079

Ube2d3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d3P61079 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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