Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P58686 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P58686 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
P58686 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
P58686 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P58686 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P58686 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P58686 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P58686 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P58686 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P58686 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
P58686 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P58686 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P58686 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P58686 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
P58686 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P58686 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P58686 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P58686 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P58686 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P58686 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P58686 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P58686 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P58686 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P58686 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P58686 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P58686 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P58686 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P58686 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P58686 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P58686 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P58686 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P58686 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P58686 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P58686 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P58686 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
P58686 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P58686 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P58686 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P58686 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P58686 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P58686 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P58686 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P58686 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P58686 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P58686 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P58686 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P58686 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P58686 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P58686 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P58686 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P58686 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
P58686 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P58686 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
P58686 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P58686 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P58686 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P58686 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P58686 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P58686 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P58686 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P58686 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P58686 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P58686 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P58686 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P58686 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P58686 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P58686 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P58686 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P58686 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P58686 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P58686 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P58686 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P58686 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P58686 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P58686 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P58686 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P58686 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P58686 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P58686 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P58686 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P58686 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P58686 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P58686 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P58686 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P58686 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P58686 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P58686 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P58686 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P58686 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P58686 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P58686 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
P58686 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P58686 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P58686 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P58686 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P58686 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P58686 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
P58686 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P58686 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms