Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms