Protein–RNA interactions for Protein: P57780

Actn4, Alpha-actinin-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn4P57780 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actn4P57780 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actn4P57780 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actn4P57780 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Actn4P57780 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actn4P57780 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Actn4P57780 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actn4P57780 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Gm10230-201ENSMUST00000119362 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Gm35216-201ENSMUST00000203777 433 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actn4P57780 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actn4P57780 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actn4P57780 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Actn4P57780 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actn4P57780 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms