Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Samsn1P57725 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Samsn1P57725 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms