Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp25P57080 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp25P57080 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp25P57080 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp25P57080 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp25P57080 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp25P57080 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp25P57080 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp25P57080 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp25P57080 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp25P57080 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp25P57080 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms