Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CckbrP56481 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CckbrP56481 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CckbrP56481 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CckbrP56481 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CckbrP56481 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CckbrP56481 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CckbrP56481 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CckbrP56481 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CckbrP56481 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CckbrP56481 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CckbrP56481 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CckbrP56481 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CckbrP56481 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CckbrP56481 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CckbrP56481 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CckbrP56481 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CckbrP56481 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CckbrP56481 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CckbrP56481 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CckbrP56481 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CckbrP56481 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CckbrP56481 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CckbrP56481 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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