Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp1P55194 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms