Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NrlP54846 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NrlP54846 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
NrlP54846 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NrlP54846 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NrlP54846 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NrlP54846 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NrlP54846 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NrlP54846 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NrlP54846 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NrlP54846 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NrlP54846 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NrlP54846 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NrlP54846 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
NrlP54846 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NrlP54846 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NrlP54846 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NrlP54846 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NrlP54846 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NrlP54846 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NrlP54846 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NrlP54846 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NrlP54846 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NrlP54846 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NrlP54846 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NrlP54846 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NrlP54846 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NrlP54846 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NrlP54846 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NrlP54846 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NrlP54846 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NrlP54846 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NrlP54846 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NrlP54846 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NrlP54846 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NrlP54846 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NrlP54846 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NrlP54846 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NrlP54846 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NrlP54846 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NrlP54846 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NrlP54846 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NrlP54846 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NrlP54846 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NrlP54846 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NrlP54846 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NrlP54846 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NrlP54846 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NrlP54846 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NrlP54846 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NrlP54846 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NrlP54846 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NrlP54846 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NrlP54846 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NrlP54846 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NrlP54846 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NrlP54846 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NrlP54846 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NrlP54846 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NrlP54846 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NrlP54846 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NrlP54846 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NrlP54846 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
NrlP54846 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NrlP54846 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NrlP54846 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NrlP54846 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NrlP54846 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NrlP54846 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NrlP54846 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NrlP54846 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NrlP54846 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NrlP54846 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NrlP54846 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NrlP54846 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NrlP54846 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NrlP54846 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NrlP54846 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NrlP54846 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NrlP54846 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NrlP54846 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NrlP54846 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NrlP54846 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NrlP54846 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NrlP54846 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
NrlP54846 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NrlP54846 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NrlP54846 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NrlP54846 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NrlP54846 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NrlP54846 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NrlP54846 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NrlP54846 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NrlP54846 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NrlP54846 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NrlP54846 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
NrlP54846 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NrlP54846 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NrlP54846 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NrlP54846 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms