Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacnb3P54285 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms