Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RabggtbP53612 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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