Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
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Map3k1P53349 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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Map3k1P53349 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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Map3k1P53349 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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Map3k1P53349 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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Map3k1P53349 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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Map3k1P53349 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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Map3k1P53349 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms