Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fgd1P52734 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fgd1P52734 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fgd1P52734 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fgd1P52734 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fgd1P52734 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fgd1P52734 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fgd1P52734 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Fgd1P52734 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fgd1P52734 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fgd1P52734 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fgd1P52734 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fgd1P52734 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fgd1P52734 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fgd1P52734 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fgd1P52734 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fgd1P52734 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fgd1P52734 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fgd1P52734 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms