Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ube2e3P52483 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e3P52483 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms