Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa6P50704 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa6P50704 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa6P50704 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa6P50704 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa6P50704 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa6P50704 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa6P50704 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms