Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TspoP50637 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TspoP50637 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TspoP50637 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TspoP50637 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TspoP50637 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
TspoP50637 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TspoP50637 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TspoP50637 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
TspoP50637 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TspoP50637 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TspoP50637 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TspoP50637 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TspoP50637 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TspoP50637 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TspoP50637 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TspoP50637 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TspoP50637 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TspoP50637 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TspoP50637 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TspoP50637 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TspoP50637 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TspoP50637 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TspoP50637 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TspoP50637 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TspoP50637 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TspoP50637 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TspoP50637 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TspoP50637 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TspoP50637 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TspoP50637 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TspoP50637 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TspoP50637 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TspoP50637 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TspoP50637 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TspoP50637 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TspoP50637 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TspoP50637 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TspoP50637 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TspoP50637 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TspoP50637 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TspoP50637 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TspoP50637 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TspoP50637 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TspoP50637 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TspoP50637 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TspoP50637 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TspoP50637 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TspoP50637 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TspoP50637 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TspoP50637 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TspoP50637 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TspoP50637 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TspoP50637 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TspoP50637 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TspoP50637 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TspoP50637 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TspoP50637 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TspoP50637 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TspoP50637 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TspoP50637 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TspoP50637 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TspoP50637 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TspoP50637 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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TspoP50637 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TspoP50637 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TspoP50637 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TspoP50637 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TspoP50637 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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TspoP50637 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TspoP50637 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TspoP50637 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TspoP50637 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TspoP50637 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TspoP50637 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TspoP50637 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TspoP50637 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TspoP50637 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TspoP50637 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TspoP50637 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TspoP50637 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TspoP50637 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TspoP50637 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TspoP50637 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TspoP50637 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TspoP50637 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TspoP50637 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TspoP50637 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TspoP50637 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TspoP50637 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TspoP50637 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TspoP50637 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TspoP50637 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TspoP50637 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TspoP50637 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TspoP50637 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TspoP50637 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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