Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
FmodP50608 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
FmodP50608 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
FmodP50608 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
FmodP50608 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
FmodP50608 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
FmodP50608 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
FmodP50608 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
FmodP50608 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
FmodP50608 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
FmodP50608 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
FmodP50608 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
FmodP50608 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
FmodP50608 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
FmodP50608 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
FmodP50608 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
FmodP50608 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
FmodP50608 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
FmodP50608 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
FmodP50608 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
FmodP50608 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
FmodP50608 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
FmodP50608 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
FmodP50608 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
FmodP50608 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
FmodP50608 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
FmodP50608 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
FmodP50608 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
FmodP50608 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
FmodP50608 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
FmodP50608 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
FmodP50608 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
FmodP50608 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
FmodP50608 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
FmodP50608 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
FmodP50608 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
FmodP50608 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
FmodP50608 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
FmodP50608 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
FmodP50608 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
FmodP50608 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
FmodP50608 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
FmodP50608 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
FmodP50608 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
FmodP50608 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
FmodP50608 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
FmodP50608 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
FmodP50608 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
FmodP50608 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
FmodP50608 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
FmodP50608 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
FmodP50608 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
FmodP50608 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
FmodP50608 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
FmodP50608 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
FmodP50608 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
FmodP50608 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
FmodP50608 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
FmodP50608 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
FmodP50608 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
FmodP50608 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
FmodP50608 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
FmodP50608 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
FmodP50608 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
FmodP50608 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
FmodP50608 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
FmodP50608 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
FmodP50608 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
FmodP50608 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
FmodP50608 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
FmodP50608 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
FmodP50608 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
FmodP50608 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
FmodP50608 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
FmodP50608 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
FmodP50608 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
FmodP50608 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
FmodP50608 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
FmodP50608 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FmodP50608 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FmodP50608 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FmodP50608 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FmodP50608 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FmodP50608 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FmodP50608 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FmodP50608 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FmodP50608 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FmodP50608 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FmodP50608 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FmodP50608 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FmodP50608 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FmodP50608 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FmodP50608 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
FmodP50608 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FmodP50608 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FmodP50608 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FmodP50608 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FmodP50608 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FmodP50608 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
FmodP50608 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms