Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LtbrP50284 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LtbrP50284 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LtbrP50284 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LtbrP50284 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms