Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
VdrP48281 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
VdrP48281 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
VdrP48281 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
VdrP48281 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
VdrP48281 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
VdrP48281 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
VdrP48281 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
VdrP48281 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
VdrP48281 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
VdrP48281 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
VdrP48281 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
VdrP48281 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
VdrP48281 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
VdrP48281 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
VdrP48281 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
VdrP48281 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
VdrP48281 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
VdrP48281 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
VdrP48281 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
VdrP48281 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
VdrP48281 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
VdrP48281 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
VdrP48281 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
VdrP48281 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
VdrP48281 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
VdrP48281 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
VdrP48281 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
VdrP48281 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
VdrP48281 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
VdrP48281 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
VdrP48281 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
VdrP48281 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
VdrP48281 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
VdrP48281 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
VdrP48281 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
VdrP48281 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
VdrP48281 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
VdrP48281 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
VdrP48281 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
VdrP48281 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
VdrP48281 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
VdrP48281 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
VdrP48281 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
VdrP48281 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
VdrP48281 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
VdrP48281 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
VdrP48281 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
VdrP48281 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
VdrP48281 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
VdrP48281 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
VdrP48281 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
VdrP48281 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
VdrP48281 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
VdrP48281 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
VdrP48281 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
VdrP48281 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
VdrP48281 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
VdrP48281 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
VdrP48281 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
VdrP48281 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
VdrP48281 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
VdrP48281 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
VdrP48281 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
VdrP48281 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
VdrP48281 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
VdrP48281 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
VdrP48281 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
VdrP48281 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
VdrP48281 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
VdrP48281 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
VdrP48281 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
VdrP48281 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
VdrP48281 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
VdrP48281 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
VdrP48281 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
VdrP48281 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
VdrP48281 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
VdrP48281 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
VdrP48281 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
VdrP48281 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
VdrP48281 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
VdrP48281 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
VdrP48281 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
VdrP48281 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
VdrP48281 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
VdrP48281 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
VdrP48281 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
VdrP48281 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
VdrP48281 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
VdrP48281 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
VdrP48281 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
VdrP48281 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
VdrP48281 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
VdrP48281 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
VdrP48281 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
VdrP48281 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
VdrP48281 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
VdrP48281 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
VdrP48281 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms