Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms