Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ItgavP43406 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ItgavP43406 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ItgavP43406 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ItgavP43406 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ItgavP43406 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ItgavP43406 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ItgavP43406 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ItgavP43406 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ItgavP43406 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ItgavP43406 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ItgavP43406 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ItgavP43406 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ItgavP43406 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ItgavP43406 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ItgavP43406 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ItgavP43406 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ItgavP43406 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ItgavP43406 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ItgavP43406 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ItgavP43406 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ItgavP43406 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ItgavP43406 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ItgavP43406 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ItgavP43406 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ItgavP43406 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ItgavP43406 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ItgavP43406 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ItgavP43406 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ItgavP43406 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ItgavP43406 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ItgavP43406 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ItgavP43406 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ItgavP43406 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ItgavP43406 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ItgavP43406 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ItgavP43406 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ItgavP43406 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ItgavP43406 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ItgavP43406 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ItgavP43406 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ItgavP43406 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ItgavP43406 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ItgavP43406 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ItgavP43406 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ItgavP43406 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ItgavP43406 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ItgavP43406 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ItgavP43406 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ItgavP43406 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ItgavP43406 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ItgavP43406 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ItgavP43406 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms