Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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