Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig1P37913 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig1P37913 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig1P37913 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lig1P37913 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lig1P37913 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms