Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rom1P32958 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rom1P32958 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rom1P32958 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rom1P32958 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rom1P32958 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rom1P32958 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rom1P32958 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rom1P32958 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rom1P32958 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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