Protein–RNA interactions for Protein: P31315

Gsx1, GS homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx1P31315 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx1P31315 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx1P31315 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx1P31315 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx1P31315 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx1P31315 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx1P31315 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx1P31315 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx1P31315 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx1P31315 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx1P31315 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx1P31315 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx1P31315 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx1P31315 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx1P31315 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx1P31315 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx1P31315 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx1P31315 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx1P31315 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx1P31315 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx1P31315 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx1P31315 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx1P31315 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx1P31315 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx1P31315 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx1P31315 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx1P31315 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx1P31315 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx1P31315 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx1P31315 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms