Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms