Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprmP28828 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprmP28828 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprmP28828 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprmP28828 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprmP28828 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprmP28828 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprmP28828 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprmP28828 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprmP28828 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprmP28828 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprmP28828 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprmP28828 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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