Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vav1P27870 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vav1P27870 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vav1P27870 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vav1P27870 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vav1P27870 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vav1P27870 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vav1P27870 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vav1P27870 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vav1P27870 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vav1P27870 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms