Protein–RNA interactions for Protein: P27808

Mgat1, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 2-beta-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgat1P27808 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mgat1P27808 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mgat1P27808 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Mgat1P27808 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mgat1P27808 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mgat1P27808 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Mgat1P27808 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mgat1P27808 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mgat1P27808 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mgat1P27808 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mgat1P27808 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mgat1P27808 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mgat1P27808 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mgat1P27808 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mgat1P27808 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mgat1P27808 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mgat1P27808 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mgat1P27808 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mgat1P27808 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Mgat1P27808 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mgat1P27808 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mgat1P27808 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mgat1P27808 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mgat1P27808 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mgat1P27808 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mgat1P27808 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mgat1P27808 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mgat1P27808 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mgat1P27808 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mgat1P27808 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mgat1P27808 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mgat1P27808 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Mgat1P27808 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mgat1P27808 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mgat1P27808 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mgat1P27808 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mgat1P27808 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mgat1P27808 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Mgat1P27808 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mgat1P27808 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mgat1P27808 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mgat1P27808 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mgat1P27808 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mgat1P27808 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mgat1P27808 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mgat1P27808 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mgat1P27808 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mgat1P27808 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mgat1P27808 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mgat1P27808 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mgat1P27808 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mgat1P27808 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mgat1P27808 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mgat1P27808 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mgat1P27808 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mgat1P27808 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mgat1P27808 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mgat1P27808 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mgat1P27808 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mgat1P27808 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mgat1P27808 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mgat1P27808 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mgat1P27808 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mgat1P27808 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mgat1P27808 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Mgat1P27808 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mgat1P27808 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Mgat1P27808 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mgat1P27808 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mgat1P27808 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mgat1P27808 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mgat1P27808 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mgat1P27808 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mgat1P27808 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mgat1P27808 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mgat1P27808 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mgat1P27808 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mgat1P27808 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mgat1P27808 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mgat1P27808 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mgat1P27808 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mgat1P27808 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mgat1P27808 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mgat1P27808 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mgat1P27808 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mgat1P27808 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mgat1P27808 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mgat1P27808 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mgat1P27808 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mgat1P27808 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mgat1P27808 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mgat1P27808 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mgat1P27808 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mgat1P27808 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mgat1P27808 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mgat1P27808 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mgat1P27808 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mgat1P27808 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Mgat1P27808 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mgat1P27808 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms