Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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