Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
U2af2P26369 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
U2af2P26369 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
U2af2P26369 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
U2af2P26369 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
U2af2P26369 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
U2af2P26369 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
U2af2P26369 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
U2af2P26369 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
U2af2P26369 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
U2af2P26369 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
U2af2P26369 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
U2af2P26369 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms