Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CftrP26361 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CftrP26361 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CftrP26361 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CftrP26361 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CftrP26361 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CftrP26361 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CftrP26361 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CftrP26361 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CftrP26361 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CftrP26361 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CftrP26361 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CftrP26361 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CftrP26361 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CftrP26361 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CftrP26361 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CftrP26361 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CftrP26361 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CftrP26361 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CftrP26361 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CftrP26361 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CftrP26361 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CftrP26361 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CftrP26361 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CftrP26361 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CftrP26361 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CftrP26361 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CftrP26361 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CftrP26361 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CftrP26361 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CftrP26361 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CftrP26361 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CftrP26361 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CftrP26361 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CftrP26361 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CftrP26361 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CftrP26361 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CftrP26361 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CftrP26361 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CftrP26361 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CftrP26361 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CftrP26361 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CftrP26361 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CftrP26361 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CftrP26361 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CftrP26361 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CftrP26361 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CftrP26361 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CftrP26361 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CftrP26361 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CftrP26361 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CftrP26361 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CftrP26361 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CftrP26361 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CftrP26361 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CftrP26361 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CftrP26361 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CftrP26361 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CftrP26361 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CftrP26361 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CftrP26361 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CftrP26361 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CftrP26361 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CftrP26361 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CftrP26361 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CftrP26361 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CftrP26361 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CftrP26361 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CftrP26361 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CftrP26361 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CftrP26361 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CftrP26361 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CftrP26361 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CftrP26361 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CftrP26361 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CftrP26361 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CftrP26361 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CftrP26361 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CftrP26361 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CftrP26361 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CftrP26361 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CftrP26361 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CftrP26361 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CftrP26361 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CftrP26361 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CftrP26361 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CftrP26361 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CftrP26361 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CftrP26361 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CftrP26361 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CftrP26361 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CftrP26361 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CftrP26361 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CftrP26361 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CftrP26361 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CftrP26361 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CftrP26361 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CftrP26361 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CftrP26361 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CftrP26361 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms