Protein–RNA interactions for Protein: P26043

Rdx, Radixin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RdxP26043 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RdxP26043 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RdxP26043 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RdxP26043 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RdxP26043 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RdxP26043 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RdxP26043 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RdxP26043 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RdxP26043 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RdxP26043 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RdxP26043 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RdxP26043 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RdxP26043 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RdxP26043 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RdxP26043 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RdxP26043 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RdxP26043 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RdxP26043 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RdxP26043 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RdxP26043 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RdxP26043 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RdxP26043 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RdxP26043 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RdxP26043 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RdxP26043 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RdxP26043 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RdxP26043 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RdxP26043 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RdxP26043 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RdxP26043 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RdxP26043 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RdxP26043 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RdxP26043 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RdxP26043 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RdxP26043 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RdxP26043 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RdxP26043 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RdxP26043 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RdxP26043 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RdxP26043 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RdxP26043 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RdxP26043 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RdxP26043 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RdxP26043 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RdxP26043 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RdxP26043 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RdxP26043 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RdxP26043 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RdxP26043 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RdxP26043 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RdxP26043 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RdxP26043 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RdxP26043 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RdxP26043 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RdxP26043 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RdxP26043 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RdxP26043 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RdxP26043 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RdxP26043 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RdxP26043 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RdxP26043 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RdxP26043 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RdxP26043 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RdxP26043 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RdxP26043 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RdxP26043 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RdxP26043 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RdxP26043 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RdxP26043 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RdxP26043 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RdxP26043 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RdxP26043 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RdxP26043 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RdxP26043 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RdxP26043 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RdxP26043 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RdxP26043 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RdxP26043 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RdxP26043 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RdxP26043 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RdxP26043 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RdxP26043 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RdxP26043 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RdxP26043 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RdxP26043 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RdxP26043 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RdxP26043 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RdxP26043 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RdxP26043 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RdxP26043 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RdxP26043 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RdxP26043 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RdxP26043 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RdxP26043 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RdxP26043 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RdxP26043 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RdxP26043 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RdxP26043 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RdxP26043 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RdxP26043 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms