Protein–RNA interactions for Protein: P26011

Itgb7, Integrin beta-7, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb7P26011 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms