Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
NdnP25233 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NdnP25233 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NdnP25233 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NdnP25233 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NdnP25233 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NdnP25233 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NdnP25233 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NdnP25233 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NdnP25233 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NdnP25233 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NdnP25233 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NdnP25233 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NdnP25233 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NdnP25233 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NdnP25233 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NdnP25233 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NdnP25233 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NdnP25233 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NdnP25233 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NdnP25233 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NdnP25233 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NdnP25233 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NdnP25233 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NdnP25233 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NdnP25233 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NdnP25233 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NdnP25233 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NdnP25233 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NdnP25233 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NdnP25233 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NdnP25233 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NdnP25233 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NdnP25233 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NdnP25233 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NdnP25233 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NdnP25233 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NdnP25233 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NdnP25233 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NdnP25233 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NdnP25233 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NdnP25233 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NdnP25233 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NdnP25233 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NdnP25233 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NdnP25233 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NdnP25233 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NdnP25233 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NdnP25233 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NdnP25233 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NdnP25233 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NdnP25233 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NdnP25233 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NdnP25233 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NdnP25233 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NdnP25233 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NdnP25233 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NdnP25233 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NdnP25233 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NdnP25233 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NdnP25233 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NdnP25233 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NdnP25233 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NdnP25233 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NdnP25233 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NdnP25233 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NdnP25233 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NdnP25233 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NdnP25233 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NdnP25233 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NdnP25233 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NdnP25233 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NdnP25233 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NdnP25233 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NdnP25233 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NdnP25233 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NdnP25233 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NdnP25233 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NdnP25233 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NdnP25233 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NdnP25233 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NdnP25233 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NdnP25233 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NdnP25233 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NdnP25233 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NdnP25233 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NdnP25233 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NdnP25233 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NdnP25233 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NdnP25233 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NdnP25233 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NdnP25233 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NdnP25233 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NdnP25233 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NdnP25233 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NdnP25233 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NdnP25233 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NdnP25233 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NdnP25233 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NdnP25233 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms