Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PparaP23204 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PparaP23204 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PparaP23204 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PparaP23204 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PparaP23204 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PparaP23204 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PparaP23204 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PparaP23204 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PparaP23204 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PparaP23204 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PparaP23204 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PparaP23204 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PparaP23204 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PparaP23204 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PparaP23204 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PparaP23204 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PparaP23204 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PparaP23204 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PparaP23204 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PparaP23204 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PparaP23204 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PparaP23204 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PparaP23204 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PparaP23204 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PparaP23204 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PparaP23204 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PparaP23204 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PparaP23204 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PparaP23204 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PparaP23204 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PparaP23204 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PparaP23204 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PparaP23204 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PparaP23204 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PparaP23204 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PparaP23204 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PparaP23204 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PparaP23204 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PparaP23204 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PparaP23204 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PparaP23204 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PparaP23204 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PparaP23204 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PparaP23204 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PparaP23204 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PparaP23204 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PparaP23204 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PparaP23204 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PparaP23204 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PparaP23204 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PparaP23204 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PparaP23204 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PparaP23204 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PparaP23204 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PparaP23204 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PparaP23204 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PparaP23204 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PparaP23204 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PparaP23204 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PparaP23204 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PparaP23204 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PparaP23204 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PparaP23204 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PparaP23204 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PparaP23204 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PparaP23204 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PparaP23204 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PparaP23204 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PparaP23204 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PparaP23204 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PparaP23204 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PparaP23204 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PparaP23204 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PparaP23204 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PparaP23204 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PparaP23204 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PparaP23204 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PparaP23204 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PparaP23204 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PparaP23204 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PparaP23204 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PparaP23204 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PparaP23204 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PparaP23204 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PparaP23204 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PparaP23204 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PparaP23204 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PparaP23204 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PparaP23204 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PparaP23204 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PparaP23204 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PparaP23204 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PparaP23204 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PparaP23204 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PparaP23204 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PparaP23204 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PparaP23204 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PparaP23204 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PparaP23204 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms