Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klra1P20937 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klra1P20937 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klra1P20937 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Klra1P20937 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klra1P20937 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klra1P20937 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klra1P20937 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klra1P20937 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms