Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prim1P20664 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prim1P20664 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prim1P20664 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prim1P20664 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prim1P20664 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prim1P20664 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prim1P20664 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prim1P20664 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms