Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
P20040 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
P20040 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
P20040 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
P20040 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
P20040 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
P20040 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
P20040 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
P20040 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
P20040 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
P20040 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
P20040 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
P20040 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
P20040 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
P20040 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
P20040 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
P20040 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
P20040 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
P20040 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
P20040 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
P20040 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
P20040 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
P20040 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
P20040 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P20040 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P20040 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P20040 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P20040 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P20040 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P20040 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
P20040 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P20040 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P20040 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P20040 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P20040 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P20040 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P20040 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P20040 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
P20040 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P20040 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P20040 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
P20040 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P20040 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P20040 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P20040 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P20040 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P20040 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
P20040 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
P20040 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P20040 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
P20040 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
P20040 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P20040 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P20040 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
P20040 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P20040 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P20040 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P20040 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P20040 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P20040 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P20040 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P20040 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P20040 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
P20040 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P20040 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P20040 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P20040 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P20040 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P20040 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
P20040 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
P20040 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
P20040 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
P20040 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.58□□□□□ -0.39
P20040 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
P20040 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
P20040 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
P20040 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
P20040 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
P20040 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
P20040 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
P20040 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
P20040 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
P20040 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
P20040 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
P20040 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
P20040 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
P20040 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
P20040 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
P20040 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
P20040 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
P20040 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
P20040 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
P20040 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
P20040 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
P20040 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
P20040 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
P20040 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
P20040 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
P20040 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
P20040 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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