Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RargP18911 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RargP18911 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RargP18911 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RargP18911 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RargP18911 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RargP18911 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RargP18911 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RargP18911 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RargP18911 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RargP18911 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RargP18911 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RargP18911 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RargP18911 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RargP18911 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RargP18911 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RargP18911 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RargP18911 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RargP18911 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RargP18911 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RargP18911 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RargP18911 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RargP18911 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RargP18911 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RargP18911 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RargP18911 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RargP18911 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RargP18911 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RargP18911 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RargP18911 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RargP18911 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RargP18911 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RargP18911 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RargP18911 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RargP18911 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RargP18911 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RargP18911 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RargP18911 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RargP18911 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RargP18911 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RargP18911 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RargP18911 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RargP18911 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RargP18911 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RargP18911 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RargP18911 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RargP18911 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RargP18911 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RargP18911 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RargP18911 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RargP18911 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RargP18911 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RargP18911 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RargP18911 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RargP18911 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RargP18911 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RargP18911 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RargP18911 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RargP18911 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RargP18911 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RargP18911 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RargP18911 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RargP18911 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RargP18911 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RargP18911 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RargP18911 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RargP18911 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RargP18911 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RargP18911 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RargP18911 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RargP18911 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RargP18911 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RargP18911 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RargP18911 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RargP18911 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RargP18911 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RargP18911 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RargP18911 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RargP18911 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RargP18911 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RargP18911 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RargP18911 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RargP18911 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RargP18911 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RargP18911 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RargP18911 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RargP18911 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RargP18911 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RargP18911 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RargP18911 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RargP18911 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RargP18911 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RargP18911 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RargP18911 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RargP18911 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RargP18911 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RargP18911 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RargP18911 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RargP18911 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RargP18911 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms