Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18530 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18530 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18530 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18530 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18530 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18530 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18530 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18530 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18530 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18530 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18530 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18530 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18530 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18530 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
P18530 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18530 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18530 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18530 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18530 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18530 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18530 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18530 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18530 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18530 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
P18530 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18530 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18530 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18530 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18530 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18530 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18530 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18530 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18530 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18530 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P18530 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18530 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18530 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18530 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18530 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18530 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18530 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18530 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18530 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18530 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18530 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18530 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18530 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18530 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
P18530 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18530 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18530 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18530 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
P18530 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
P18530 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18530 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18530 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
P18530 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
P18530 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18530 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18530 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
P18530 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
P18530 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18530 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18530 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
P18530 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18530 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18530 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
P18530 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18530 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
P18530 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18530 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18530 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18530 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18530 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18530 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18530 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18530 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18530 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18530 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P18530 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18530 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18530 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18530 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18530 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18530 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18530 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
P18530 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18530 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18530 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18530 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18530 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18530 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18530 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18530 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
P18530 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
P18530 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
P18530 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18530 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18530 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms