Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp53P15975 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp53P15975 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp53P15975 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp53P15975 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp53P15975 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp53P15975 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp53P15975 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp53P15975 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp53P15975 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp53P15975 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp53P15975 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp53P15975 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp53P15975 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp53P15975 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp53P15975 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp53P15975 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp53P15975 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp53P15975 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp53P15975 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp53P15975 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms