Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
P10404 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
P10404 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
P10404 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
P10404 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
P10404 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
P10404 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
P10404 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
P10404 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
P10404 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
P10404 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
P10404 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
P10404 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
P10404 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
P10404 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
P10404 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
P10404 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
P10404 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
P10404 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
P10404 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
P10404 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
P10404 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
P10404 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
P10404 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
P10404 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
P10404 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
P10404 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
P10404 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
P10404 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
P10404 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
P10404 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
P10404 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
P10404 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
P10404 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
P10404 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
P10404 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P10404 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P10404 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
P10404 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P10404 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P10404 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P10404 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
P10404 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P10404 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
P10404 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P10404 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
P10404 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P10404 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P10404 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
P10404 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
P10404 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P10404 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
P10404 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
P10404 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P10404 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
P10404 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
P10404 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
P10404 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P10404 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P10404 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
P10404 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P10404 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
P10404 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
P10404 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P10404 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
P10404 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P10404 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P10404 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
P10404 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
P10404 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
P10404 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P10404 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P10404 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P10404 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
P10404 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
P10404 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P10404 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P10404 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
P10404 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P10404 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
P10404 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P10404 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P10404 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P10404 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P10404 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P10404 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P10404 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P10404 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P10404 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P10404 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P10404 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
P10404 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P10404 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P10404 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
P10404 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
P10404 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
P10404 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
P10404 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
P10404 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
P10404 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
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