Protein–RNA interactions for Protein: P01656

Ig kappa chain V-III region MOPC 70, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01656 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01656 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
P01656 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01656 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01656 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01656 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01656 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01656 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01656 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01656 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01656 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01656 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01656 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01656 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01656 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01656 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01656 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01656 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01656 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P01656 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01656 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01656 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01656 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01656 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01656 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01656 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01656 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P01656 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P01656 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01656 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01656 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01656 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01656 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01656 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P01656 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P01656 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01656 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P01656 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01656 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01656 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01656 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01656 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01656 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01656 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01656 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01656 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01656 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01656 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P01656 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01656 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01656 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01656 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01656 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01656 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01656 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01656 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01656 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01656 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01656 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01656 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01656 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01656 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01656 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01656 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P01656 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01656 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01656 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01656 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01656 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01656 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01656 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01656 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01656 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01656 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01656 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01656 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P01656 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01656 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01656 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01656 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01656 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P01656 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01656 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01656 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01656 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01656 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01656 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01656 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01656 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01656 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01656 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01656 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01656 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01656 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01656 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01656 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01656 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01656 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01656 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01656 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms