Protein–RNA interactions for Protein: P01653

Ig kappa chain V-V region W3082, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01653 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01653 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
P01653 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01653 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01653 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01653 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01653 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01653 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01653 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01653 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01653 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01653 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01653 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01653 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01653 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01653 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01653 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P01653 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P01653 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01653 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01653 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01653 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01653 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01653 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01653 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01653 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P01653 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01653 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01653 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P01653 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P01653 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01653 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P01653 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01653 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01653 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P01653 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01653 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01653 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01653 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01653 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01653 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01653 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01653 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01653 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01653 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01653 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01653 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01653 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01653 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01653 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01653 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01653 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01653 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01653 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01653 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01653 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01653 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01653 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01653 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01653 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01653 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01653 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01653 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01653 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01653 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01653 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01653 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01653 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01653 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01653 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01653 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01653 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01653 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01653 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01653 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01653 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01653 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01653 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01653 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01653 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01653 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01653 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01653 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01653 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01653 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01653 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01653 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01653 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P01653 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01653 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01653 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01653 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01653 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01653 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P01653 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01653 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P01653 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P01653 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01653 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01653 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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