Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CopeO89079 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CopeO89079 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CopeO89079 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CopeO89079 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CopeO89079 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CopeO89079 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CopeO89079 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CopeO89079 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CopeO89079 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CopeO89079 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CopeO89079 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CopeO89079 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CopeO89079 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CopeO89079 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CopeO89079 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CopeO89079 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CopeO89079 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CopeO89079 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CopeO89079 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CopeO89079 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CopeO89079 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CopeO89079 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CopeO89079 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CopeO89079 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CopeO89079 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CopeO89079 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CopeO89079 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CopeO89079 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CopeO89079 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CopeO89079 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CopeO89079 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CopeO89079 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CopeO89079 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CopeO89079 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CopeO89079 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CopeO89079 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CopeO89079 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CopeO89079 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CopeO89079 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CopeO89079 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CopeO89079 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CopeO89079 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CopeO89079 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CopeO89079 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CopeO89079 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CopeO89079 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CopeO89079 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CopeO89079 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CopeO89079 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CopeO89079 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CopeO89079 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CopeO89079 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CopeO89079 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CopeO89079 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CopeO89079 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CopeO89079 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CopeO89079 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CopeO89079 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CopeO89079 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CopeO89079 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CopeO89079 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CopeO89079 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CopeO89079 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CopeO89079 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CopeO89079 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CopeO89079 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CopeO89079 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CopeO89079 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CopeO89079 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CopeO89079 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CopeO89079 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CopeO89079 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CopeO89079 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CopeO89079 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CopeO89079 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CopeO89079 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CopeO89079 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CopeO89079 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CopeO89079 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CopeO89079 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CopeO89079 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CopeO89079 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CopeO89079 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CopeO89079 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CopeO89079 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CopeO89079 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CopeO89079 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CopeO89079 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CopeO89079 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CopeO89079 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CopeO89079 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CopeO89079 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CopeO89079 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CopeO89079 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CopeO89079 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CopeO89079 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CopeO89079 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CopeO89079 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CopeO89079 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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