Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BlmO88700 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BlmO88700 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BlmO88700 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BlmO88700 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BlmO88700 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BlmO88700 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BlmO88700 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BlmO88700 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BlmO88700 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BlmO88700 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BlmO88700 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BlmO88700 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BlmO88700 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BlmO88700 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BlmO88700 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BlmO88700 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BlmO88700 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BlmO88700 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BlmO88700 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BlmO88700 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BlmO88700 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BlmO88700 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BlmO88700 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BlmO88700 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BlmO88700 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BlmO88700 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BlmO88700 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BlmO88700 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BlmO88700 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BlmO88700 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BlmO88700 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BlmO88700 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BlmO88700 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BlmO88700 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BlmO88700 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
BlmO88700 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BlmO88700 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
BlmO88700 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BlmO88700 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BlmO88700 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BlmO88700 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BlmO88700 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BlmO88700 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BlmO88700 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BlmO88700 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BlmO88700 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BlmO88700 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BlmO88700 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BlmO88700 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BlmO88700 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BlmO88700 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BlmO88700 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BlmO88700 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BlmO88700 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BlmO88700 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BlmO88700 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BlmO88700 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BlmO88700 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BlmO88700 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BlmO88700 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BlmO88700 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BlmO88700 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BlmO88700 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BlmO88700 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BlmO88700 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BlmO88700 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BlmO88700 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BlmO88700 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BlmO88700 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BlmO88700 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BlmO88700 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BlmO88700 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BlmO88700 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BlmO88700 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BlmO88700 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BlmO88700 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BlmO88700 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BlmO88700 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BlmO88700 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
BlmO88700 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BlmO88700 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BlmO88700 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BlmO88700 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BlmO88700 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BlmO88700 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BlmO88700 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BlmO88700 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BlmO88700 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BlmO88700 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BlmO88700 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BlmO88700 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BlmO88700 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BlmO88700 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BlmO88700 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BlmO88700 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BlmO88700 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BlmO88700 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BlmO88700 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BlmO88700 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms