Protein–RNA interactions for Protein: O88575

Slc6a20b, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3B, mousemouse

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Length 635 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20bO88575 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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Slc6a20bO88575 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a20bO88575 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a20bO88575 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Slc6a20bO88575 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a20bO88575 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a20bO88575 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a20bO88575 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a20bO88575 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Slc6a20bO88575 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a20bO88575 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a20bO88575 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a20bO88575 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Slc6a20bO88575 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a20bO88575 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a20bO88575 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a20bO88575 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a20bO88575 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a20bO88575 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a20bO88575 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Slc6a20bO88575 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a20bO88575 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Slc6a20bO88575 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a20bO88575 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Slc6a20bO88575 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Slc6a20bO88575 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Slc6a20bO88575 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a20bO88575 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Slc6a20bO88575 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a20bO88575 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Slc6a20bO88575 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a20bO88575 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a20bO88575 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a20bO88575 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a20bO88575 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a20bO88575 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a20bO88575 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a20bO88575 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a20bO88575 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a20bO88575 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a20bO88575 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a20bO88575 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a20bO88575 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a20bO88575 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a20bO88575 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a20bO88575 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a20bO88575 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a20bO88575 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a20bO88575 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a20bO88575 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a20bO88575 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a20bO88575 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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