Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxq1O70220 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxq1O70220 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxq1O70220 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxq1O70220 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxq1O70220 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxq1O70220 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxq1O70220 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxq1O70220 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxq1O70220 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxq1O70220 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxq1O70220 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxq1O70220 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxq1O70220 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxq1O70220 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxq1O70220 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxq1O70220 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxq1O70220 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxq1O70220 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms