Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Copb2O55029 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copb2O55029 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Copb2O55029 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Copb2O55029 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Copb2O55029 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Copb2O55029 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Copb2O55029 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Copb2O55029 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Copb2O55029 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms